Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vps8Q0P5W1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps8Q0P5W1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms