Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc21bQ0HA38 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms