Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnnm1Q0GA42 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms