Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tff1Q08423 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tff1Q08423 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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