Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms