Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms