Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Apoc2Q05020 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms