Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sox12Q04890 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms