Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd1Q01822 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms