Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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HmgcrQ01237 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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HmgcrQ01237 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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HmgcrQ01237 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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HmgcrQ01237 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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HmgcrQ01237 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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HmgcrQ01237 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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HmgcrQ01237 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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HmgcrQ01237 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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HmgcrQ01237 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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