Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pde1bQ01065 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pde1bQ01065 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pde1bQ01065 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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