Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SeleQ00690 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms