Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atp9bP98195 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms