Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psme1P97371 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psme1P97371 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms