Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
H3f3aP84244 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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