Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Otx1P80205 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Otx1P80205 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Otx1P80205 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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