Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tp53bp1P70399 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tp53bp1P70399 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tp53bp1P70399 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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