Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gfi1P70338 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms