Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps11P62281 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps11P62281 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps11P62281 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms