Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rpl27P61358 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms