Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CgnP59242 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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