Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Strn4P58404 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Strn4P58404 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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