Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
CartptP56388 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
CartptP56388 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
CartptP56388 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms