Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sh3bp1P55194 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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