Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pa2g4P50580 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pa2g4P50580 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pa2g4P50580 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pa2g4P50580 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pa2g4P50580 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pa2g4P50580 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pa2g4P50580 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pa2g4P50580 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pa2g4P50580 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pa2g4P50580 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms