Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CitP49025 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CitP49025 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CitP49025 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CitP49025 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CitP49025 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
CitP49025 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CitP49025 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CitP49025 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CitP49025 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CitP49025 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CitP49025 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms