Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gli1P47806 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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