Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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Mmp9P41245 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Mmp9P41245 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Mmp9P41245 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Mmp9P41245 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Mmp9P41245 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Mmp9P41245 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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