Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TtlP38585 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TtlP38585 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms