Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms