Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Hoxc11P31313 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxc11P31313 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxc11P31313 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxc11P31313 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxc11P31313 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hoxc11P31313 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc11P31313 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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