Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cd28P31041 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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