Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gjb1P28230 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gjb1P28230 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms