Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eif3aP23116 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eif3aP23116 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms