Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SftpcP21841 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SftpcP21841 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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SftpcP21841 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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