Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PrkcaP20444 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms