Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms