Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P20040 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P20040 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P20040 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P20040 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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