Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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