Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnnc1P19123 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms