Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PtpraP18052 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PtpraP18052 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PtpraP18052 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms