Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxb1P17919 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms