Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DmdP11531 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
DmdP11531 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DmdP11531 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DmdP11531 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
DmdP11531 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
DmdP11531 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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DmdP11531 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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DmdP11531 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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DmdP11531 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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DmdP11531 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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DmdP11531 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
DmdP11531 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms