Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms