Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxb4P10284 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms