Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl2P10148 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms