Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LtaP09225 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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LtaP09225 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtaP09225 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtaP09225 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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LtaP09225 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LtaP09225 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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LtaP09225 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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LtaP09225 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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LtaP09225 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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LtaP09225 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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LtaP09225 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LtaP09225 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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