Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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PtprcP06800 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprcP06800 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PtprcP06800 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprcP06800 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprcP06800 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PtprcP06800 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprcP06800 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprcP06800 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprcP06800 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprcP06800 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprcP06800 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprcP06800 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PtprcP06800 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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PtprcP06800 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprcP06800 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms