Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P04212 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P04212 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P04212 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P04212 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms