Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms